理科の先生が残した爪痕は、ゲームクリア後のユーザーコミュニティにおいてより色濃く確認できます。イラストコミュニケーションサービス「pixiv」では、名もなき脇役でありながら単独タグ「#理科の先生」で140件を超えるイラストや70件以上の二次創作小説が投稿されています。
Yahoo!知恵袋や大手掲示板の過去ログを振り返ると、「理科の先生は初代以降も登場するのか？」「あの色気のある先生の正体は何だったのか」という質問がシリーズ展開の節目ごとに投稿されてきました。特にケータとの関係性にフォーカスした創作文化（いわゆる「理科ケー」）は、ゲーム内のキュウビがケータに対して見せる特別な執着やからかいの態度を深掘りしたファン層から熱烈な支持を獲得しました。制作者が過剰に語りすぎず、プレイヤー側の想像力（行間を読む余白）を多分に残したキャラクターデザインが、息の長い人気を支える原動力となったのです。
