地下3階から地上2階まで連なる館内において、来館者が最初に息をのむ空間がシスティーナ・ホール（システィーナ礼拝堂）です。バチカン宮殿にあるミケランジェロの天井画・壁画『最後の審判』を、空間そのものごと立体再現した環境展示となっています。
ここは2018年のNHK紅白歌合戦にて、徳島県出身のアーティスト・米津玄師さんが名曲『Lemon』を幻想的なキャンドルの中で歌唱した場所としても全国的な脚光を浴びました。放映から年数が経過した現在でも、音楽とアートが交差した奇跡の舞台を一目見ようと訪れるファンが後を絶ちません。
その他にも、ジョットの傑作に囲まれる「スクロヴェーニ礼拝堂」や、自然光が降り注ぐ屋外展示「モネの大睡蓮」、レオナルド・ダ・ヴィンチの『モナ・リザ』や『最後の晩餐（修復前・修復後）』など、通常の海外美術館巡りでも一度に鑑賞することが不可能な名作が一堂に会しています。すべて触れる距離で写真撮影が可能な点も、来館者を魅了する大きな要素です。
