地下鉄博物館の展示において、絶対に素通りしてはならない至宝が「銀座線1001号車」です。1927年（昭和2年）に上野〜浅草間で東洋初の地下鉄として開業した際の実物車両であり、その歴史的価値が認められ、2017年には鉄道車両として歴史の浅い地下鉄車両でありながら国の重要文化財に指定されました。車内に足を踏み入れれば、暖かみのある木目調の壁面、リコ式と呼ばれる独特のつり革、そして駅進入時のデッドセクションで灯る予備灯など、昭和初期の技術者の熱意が克明に再現されています。
また、鮮やかな黄色と赤いボディで戦後復興を支えた丸ノ内線「301号車」もカットモデルではなく丸ごと保存されており、車両下部の台車構造や集電靴（サードレールから給電する仕組み）を間近で観察できます。さらに、地中を掘り進んだ実物大のシールドマシンのモックアップやトンネル工法の変遷解説は、土木建築ファンをも唸らせる完成度を誇ります。
家族連れや長時間滞在者が気になるランチ事情ですが、館内には持参したお弁当や軽食を食べられる「休憩コーナー」が設置されています。飲食の持ち込みが可能となっており、飲料の自動販売機も備えられています。展示フロア内での飲食は厳禁ですが、高架下の指定スペースで一息つける配慮は、長時間の見学において大きな助けとなります。また、葛西駅周辺には飲食店やコンビニエンスストアが多数集積しているため、退館後に駅前で昼食を取る選択肢も極めて容易です。
