名古屋港水族館のシャチを語る上で避けて通れないのが、国内における血統管理と移動のドラマです。2024年の神戸須磨シーワールド開業に際し、長年名古屋の象徴であったメスの「ステラ」と、その娘「ラン」が神戸へと移籍しました。SNSでは「なぜ名古屋からいなくなってしまうのか」と悲痛な声も上がりましたが、この移籍は日本国内のシャチの絶滅を防ぐための戦略的繁殖計画（ブリーディングローン）に基づいています。
日本における飼育下シャチの血統は、鴨川シーワールドの繁殖成功に端を発しています。母ステラと父ビンゴ（2014年死亡）の間に生まれた子どもたちが各館に分散しており、血縁関係が極めて濃い状態にあります。
- 長女：ラビー（鴨川シーワールドで繁殖に成功）
- 次女：ララ（鴨川シーワールド）
- 三女：サラ（2006年に夭折）
- 四女：アース※ラビーの息子であり、ステラから見れば孫（名古屋港水族館）
- 五女：ラン（鴨川から名古屋を経て、現在神戸須磨シーワールド）
- 六女：リン（名古屋港水族館で誕生・在籍中）
これまでに名古屋港水族館が歩んできた飼育の歴史は、決して平坦なものではありませんでした。2003年に和歌山県太地町から迎えた初代シャチ「クー」は、2008年に感染症（ウイルス性および真菌性肺炎）により死亡。2010年に同じく太地町から導入された「ナミ」も、わずか数カ月後の2011年に消化管障害（異物誤飲に伴う胃潰瘍・感染症）で急逝しました。さらに、2011年に鴨川から迎えられた大黒柱のオス「ビンゴ」も2014年に呼吸不全で命を落としています。
これらの痛ましい別れから得られた教訓は、濾過設備の徹底強化や内視鏡による定期検査、日常的な体温モニタリング技術へと昇華されました。血統の偏りを回避しながら、唯一の成熟オスであるアースの遺伝子をどう次世代へ残すかという国家レベルの繁殖課題が、現在の2頭体制の根底に存在しています。
