民間フィットネスや民営フットサルコートと比較して、圧倒的なコストパフォーマンスを誇るのが公営施設ならではの強みです。三郷市総合体育館の利用料金は、市内在住・在勤・在学者が優遇される料金体系となっています。
特に人気を集める三郷市総合体育館のトレーニングルームは、市内一般区分の利用者であれば1回あたり200円〜300円前後の低価格で時間制限なくマシントレーニングを行えます。市外在住者でも割増料金（約1.5倍〜2倍）を支払えば利用可能です。メインアリーナやサブアリーナ、武道場などを団体で貸し切る場合も、時間帯（午前・午後・夜間）ごとに明確な区分料金が設定されており、サークル活動や大会運営の強い味方となっています。
