事件現場の最前線でコナンたちと対峙する警視庁の面々も、物語に不可欠な彩りを与える。高木渉刑事と佐藤美和子警部の不器用ながらも深い愛の絆、目暮十三警部の重厚なリーダーシップ、そして白鳥任三郎や千葉和伸たちの恋愛模様。警察機構としてのリアルな捜査活動と、等身大の人間ドラマが見事に同居している。
さらに、長野県警の大和敢助や諸伏高明、服部平次や遠山和葉が所属する大阪府警など、地方警察の精鋭たちも交差する。彼らの存在は単なる事件解決の協力者にとどまらず、黒ずくめの組織を巡る国家規模の暗闘においても重要な役割を果たしつつある。