多くの工業高校が入学時点で機械科や電気科に分かれるのに対し、愛知総合工科高校の学科・コース編成はくくり募集（1年次は全員共通カリキュラム）を採用しています。入学後の1年間で工業の全般的な基礎（機械、電気、情報、建設、デザインなど）を幅広く体験した上で、2年次から自身の適性に合った専門コースを選択するシステムです。
選択できる専門領域は、ロボット・精密機械制御、電気電子工学、情報通信・システム開発、都市建設・建築デザインなど多岐にわたります。この「入ってから適性を見極められる柔軟さ」が、ミスマッチを防ぎたい受験生や保護者から高い評価を得ています。
校舎と学習環境は、公立高校の域を完全に超えています。数億円規模の最先端工作機械、クリーンルーム、3Dプリンター、大型風洞実験設備など、工科系大学の実験棟に匹敵するキャンパス施設・設備が配備されています。
生活面においては、清潔感のある濃紺を基調とした洗練されたブレザー制服が採用されており、生徒間の評判も上々です。校則に関しては、将来の産業界で即戦力となるプロフェッショナルを育てる方針から、頭髪や服装、実習時の安全規律については一定の厳格さをもって指導されます。スマートフォンの校内利用にも一定のルールが設けられていますが、自主性を重んじる校風とバランスが取られています。
