物語の舞台となる「階段島」は、海に囲まれ、外界との交通手段が完全に遮断された人口約2,000人の孤島です。島民たちは「自分がなぜここに来たのか」という記憶を失っており、島を出る唯一の条件は「自分が失くしたものを見つけること」とされていました。
この不可解な島の正体こそ、本作最大の仕掛けです。階段島は地理的な離島ではなく、現実世界の人間が「生きていく上で邪魔だと切り捨てた人格（影）」が実体化して暮らしている場所でした。
現実の社会で傷つかずに生きるため、人は時に「純粋すぎる正義感」「激しい激情」「過剰な悲観」などを切り捨てて成長します。そうして捨てられた不完全な魂のかけらを受け入れ、保護していたのが階段島というゆりかごだったのです。
この設定が明らかになったとき、主人公・七草とヒロイン・真辺由宇の関係性は根底から覆ります。
階段島にいる真辺由宇は、現実世界の真辺が「正しすぎて周囲と軋轢を生んでしまう自分」に耐えかねて切り離した「純粋無垢な理想主義そのもの」でした。一方、彼女を誰よりも理解し、その無謀な正しさを守ろうとしていた七草の正体は、「現実の真辺由宇が捨て去った、ネガティブで諦めがちな心（悲観主義）」だったのです。
つまり、七草と真辺由宇は幼馴染であると同時に、精神的には「ひとりの人間から分かたれた表裏一体の半身」という衝撃的な関係性にありました。真辺が階段島に来た理由、そして七草が彼女の階段島脱出を頑なに阻止しようとした理由は、島を出て現実の真辺と統合されれば、彼女の「純粋な正しさ」が失われてしまうことを七草が恐れたためでした。
