日暮里サニーホールの主軸となる「ホール」は、最大収容人数約400席（固定・可動席）を備えた可変型空間です。座席配置は公演形態によってレイアウトが変化しますが、標準的な階段状のひな壇席が組まれる場合、後方列でも前の人の頭が視界を遮りにくい構造になっています。
客席前方（1列目〜数列目）はステージと同じ高さの平土間フロアにパイプ椅子を配置するケースが多く、ステージとの距離が非常に近い反面、視線がフラットになるため身長差による見えにくさが生じることがあります。一方、中段以降の段差席は傾斜がしっかり確保されており、ステージ全体や演奏者の手元まで見渡しやすい視界が広がります。
また、同フロアには約100席規模の「コンサートサロン」も併設されています。こちらはサロンコンサートやピアノソロ、室内楽、小規模な発表会に特化しており、演奏者の息づかいがダイレクトに伝わる密度の高い空間として人気を集めています。
