私立高校への進学で保護者が最も懸念するのが学費負担です。札幌北斗高校では、家庭の経済的負担を軽減するための公的制度の活用と、学校独自の奨学金制度が手厚く用意されています。
年間の標準的な学費は、授業料、教育充実費、PTA会費などを合わせて約45万〜50万円前後（初年度は別途入学金約20万円や制服代・修学旅行積立金等が必要）となっています。しかし、国の「高等学校等就学支援金」や北海道独自の授業料軽減補助金を利用することで、世帯年収に応じて授業料の実質無償化、あるいは大幅な減免措置が適用されます。
さらに注目すべきは、札幌北斗高校独自の「特別奨学生制度」および「優遇奨学生制度」です。
- 学業特待（特別奨学生）：中学校での内申ランク（A〜Cランク等）や入試成績の優秀者に対し、入学金や授業料の全額・半額を免除する制度。
- 部活動特待（優遇奨学生）：バレーボール部など特定の強化指定部活動において、中学校時代に顕著な実績を残した生徒を対象とする減免措置。
これらの制度が適用された場合、公立高校に通うのと同等、あるいはそれ以下の負担で私立の手厚い教育環境を享受できるため、経済面でのメリットは想像以上に大きくなります。
