パワースポット巡りを楽しむ上で、決して見過ごしてはならないのが「神社との相性」や「心身への負荷」に関する科学的・現実的な視点です。スピリチュアル界隈では「参拝後に熱が出たり頭痛がしたりするのは好転反応である」と安易に説明されがちですが、これには重大な盲点が存在します。
特に三峯神社のような標高1,100メートルを超える山岳神社へ向かう場合、平地と山頂では気圧差が約120hPa、気温差は6℃〜8℃以上に達します。日常のデスクワークで自律神経が乱れている人が、早朝の慣れない長距離運転を経て急激な寒暖差と気圧変化にさらされれば、自律神経失調による頭痛や倦怠感を引き起こすのは医学的に極めて自然な現象です。それを無理に「神仏のエネルギー当たり」と解釈して休息を怠ると、体調を本格的に崩す原因となります。
また、川越氷川神社の「縁結び玉」（境内の玉砂利を巫女が麻の網で包んだ限定授与品／毎朝限定20体）などを求めて、未明から境内に並ぶ行為も注意が必要です。極度の睡眠不足状態で神聖な儀礼に臨んでも、精神的な焦燥感が増すばかりで、本末転倒な結果に終わりかねません。形式的な授与品集めに執着するあまり、境内で他者を押しのけたり苛立ちを募らせたりする参拝態度は、神社が最も尊ぶ「清らかな心（清明心）」から最も遠ざかる行為です。
