国公立医学部受験において、滋賀医科大学医学部は近畿圏のみならず東海・北陸・首都圏からも実力派の受験生が集う激戦区です。大手予備校の最新偏差値データによると、医学部医学科の偏差値は67.5前後（共通テストボーダー得点率82〜84%水準）、看護学科は偏差値52.5前後（共通テストボーダー60〜63%水準）で推移しています。
前期日程における一般選抜の入試倍率は、医学科で例年3.0倍〜4.5倍程度、看護学科で1.5倍〜2.5倍程度を記録。滋賀医科大学の個別学力検査（2次試験）は、数学・理科（2科目）・英語の記述試験に加え、面接（個別面接・小論文等）が課され、基礎から標準レベルの問題をいかに失点なく解き切るかという「高い処理精度」が合否を分けます。
入試選考の透明性は高く、公表されている合格最低点データからも、共通テストと2次試験の合計得点率でおおむね70%〜75%（年度の難易度により変動）がボーダーラインとして機能していることが確認できます。
