公立中学校のため公式な「学校偏差値」という指標は存在しませんが、保護者の間での教育関心は高く、大森第三中学校の学力レベルは区内でも安定した上位グループに位置付けられています。定期テストの難易度や授業の進度は標準的ですが、早い段階から高校受験を見据えて近隣の大手学習塾に通う生徒が多く、互いに切磋琢磨する雰囲気が自然と醸成されています。
近年の進学先を見ると、都立高校では日比谷高校、戸山高校、三田高校、小山台高校、雪谷高校といった人気校・上位校へ合格者をコンスタントに輩出しています。また、神奈川・東京の私立難関校（早慶MARCH附属校）や中堅実力校への推薦・一般受験での進学実績も目立ちます。進路指導においては、単なる偏差値重視ではなく、生徒一人ひとりの将来像や適性に合わせたきめ細かな面談が行われており、進路決定率の高さにも定評があります。
