源じいの森の最大の魅力の一つが、敷地内をゆったりと流れる今川での川遊びです。水質が極めて良好で、夏場には天然のウォータースライダーのように滑れる岩場や浅瀬が広がり、多くの子どもたちが水生生物の観察や水遊びに熱中します。
また、施設名に冠されている通り、初夏（5月下旬〜6月上旬）には敷地一帯でホタルが乱舞する幻想的な光景が広がります。本館であるほたる館周辺では、ホタルの生態に関する展示や案内も行われており、自然教育の場としても高く評価されています。
ただし、自然河川ゆえの注意点も存在します。前日の降雨による急な増水や、見た目以上に水流が速い深みも一部に点在します。「足首程度の浅瀬であってもライフジャケットを常時着用させる」「飲酒後の遊泳は厳禁」という基本的な水難事故防止策の徹底が不可欠です。施設側でも注意喚起を行っていますが、保護者による常時監視が快適な滞在の前提条件となります。
