名古屋駅直結の巨大ツインタワー構造において、来訪者が最も混同しやすいのが「ジェイアール名古屋タカシマヤ（本館）」と「タカシマヤ ゲート タワー モール（TGM）」の明確な違いです。運営母体は同じジェイアール東海髙島屋ですが、両者のターゲット層やMD（商品政策）には明確な棲み分けが存在します。
本館はラグジュアリーブランド、デパ地下の高級生鮮・スイーツ、フォーマルウェアを中心とした伝統的百貨店スタイルです。一方、JRゲートタワーの地下1階から8階を占めるゲートタワーモールは、人気セレクトショップ、トレンドコスメ、生活雑貨、話題のカフェなどを集約した都市型ファッションビルとしての性格を持っています。各階の連絡通路（3F〜8F等）で両館は直結しており、雨に濡れることなく自在に行き来できる設計がなされています。
フロア構成の基本概要は以下の通りです：
- 地下1階〜地上8階：ファッション、コスメ、雑貨、大型書店（三省堂書店）、生活雑貨（ロフトなど）が揃う「タカシマヤ ゲート タワー モール」ショッピングゾーン（営業時間 10:00〜21:00）
- 9階・10階：「ビックカメラ 名古屋JRゲートタワー店」
- 11階：ユニクロ・ジーユー
- 12階・13階：日本最大級の駅上レストラン街「ゲートタワープラザ レストラン街」（営業時間 11:00〜23:00 ※店舗により一部異なる）
- 15階：ホテルロビー（名古屋JRゲートタワーホテル）、オフィスエントランス、日本一高い場所にあるスターバックス（地上約70mの絶景テラス席）
