旅行者が最も気になるポイントは、現地での実際の待機時間です。週末や大型連休のランチピーク（11:30〜13:30）における別府東洋軒の待ち時間と混雑状況は、平日であっても30分〜50分、土日祝日や観光シーズンには最大90分〜120分以上に達することが珍しくありません。ディナータイム（17:00〜19:30）も同様に混み合いますが、ランチに比べると比較的回転が早い傾向にあります。
長時間の行列によるストレスを緩和するため、店舗では別府東洋軒の整理券システム（店頭のEPARKタッチパネル発券機）が常時稼働しています。来店後すぐに受付機で人数を入力して整理券を発券すると、券面に印字されたQRコードから現在の呼出状況をスマートフォンでリアルタイムに確認できます。
このシステムの導入により、炎天下や厳冬期に店前で立ち続ける必要はありません。駐車場内の自家用車内や、近隣の散策スポットで待機し、呼出番号が近づいた段階で店頭の待合フロアへ戻るスマートな行動が可能です。ただし、呼出から一定時間を過ぎると自動キャンセル扱いとなるリスクがあるため、通知LINEやWEB確認画面のチェックは怠らないように注意してください。
