八王子学園の真骨頂は、進学実績だけに留まらない圧倒的な部活動の強さにある。なかでも男子バスケットボール部は全国屈指の強豪としてその名を轟かせており、全国高等学校バスケットボール選手権大会（ウインターカップ）における常連校として幾度となく劇的な名勝負を繰り広げてきた。日本代表でも活躍したプロバスケットボール選手の辻直人選手をはじめ、トップカテゴリーで躍動するアスリートを数多く輩出している。
文化部において全国にその名を轟かせているのが吹奏楽部だ。全日本吹奏楽コンクールにおける度重なる金賞受賞など、その演奏技術と表現力は高校生の域を遥かに凌駕する。放課後の校舎に響き渡る迫真のサウンドは、部員たちの妥協なき努力の結晶だ。
スポーツ推薦の生徒だけでなく、一般進学コースや特進コースに在籍しながらハードな部活動を両立させる生徒も珍しくない。「時間の使い方を徹底的に自己管理する習慣」が部活動を通じて養われ、それが結果として大学受験の粘り強さへと直結している。
