生理が始まると急にお腹を下す最大の原因は、子宮内膜から分泌される生理活性物質「プロスタグランジン（PG）」の過剰分泌にあります。女性の体内では、不要になった子宮内膜を経血として体外へ排出するために子宮を収縮させます。この収縮を促す物質こそがプロスタグランジンです。
しかし、分泌されたプロスタグランジンが血液を介して周辺臓器へ移行すると、子宮のすぐ背面に位置する大腸や小腸の平滑筋まで強く収縮させてしまいます。その結果、腸の蠕動（ぜんどう）運動が異常に活発化し、便の水分が十分に吸収されないまま急速に直腸へ送られ、激しい腹痛を伴う水様便や軟便（下痢）が引き起こされます。
さらに、月経周期に伴う女性ホルモンの劇的な変動も下痢の引き金となります。排卵後から生理直前にかけて分泌が高まる「プロゲステロン（黄体ホルモン）」は、体内に水分を蓄え、消化管の運動を抑制する働きを持ちます。そのため生理前は頑固な便秘になりがちです。ところが、生理開始とともにプロゲステロンの分泌量が急激に激減し、プロスタグランジンが一気に急増するため、腸の動きが「停滞」から「過活動」へと極端に反転します。これが「生理前は便秘、生理中は下痢」という特有のリズムを生み出す正体です。
