現地を訪れる際に最も注意したいのが、営業スケジュールと混雑のピークです。知床食堂の営業時間は通常午前9時前後から夕方（16時〜17時頃）までとなっており、季節（夏季観光シーズンと冬季）によってラストオーダーの時間が変動します。ディナー営業は基本的に行われていないか早仕舞いするため、昼食をメインにスケジュールを組むのが鉄則です。
特に7月〜9月の観光最盛期や大型連休には、知床食堂の混雑状況がピークに達し、11時30分から13時30分のランチタイムには1時間〜2時間待ちの行列ができることも珍しくありません。混雑をスマートに回避するためには、開店直後の午前9時台〜10時台に訪れて早めのブランチとするか、14時以降のピークオフを狙うのが賢明な戦略です。
