ネット上では長年、「藤本美貴はモーニング娘。のメンバーと不仲だったのではないか」「グループを軽視していたのではないか」という憶測が語られることがありました。しかし、これらは明らかな誤解です。
実際には、後藤真希や松浦亜弥とはプライベートでも親交を深め、6期生の後輩たちに対しても歌唱やパフォーマンスの基準を妥協なく教え込む教育的役割を担っていました。また、2008年以降のハロプロOG公演や記念コンサートには度々サプライズ出演を果たし、後輩現役メンバーとも積極的にコラボレーションを行っています。
「モーニング娘。にいたからこそ今の自分がある」と各メディアで公言しており、脱退という形を取った後もハロー!プロジェクトに対する深い敬意と愛着を持ち続けていることが、関係者や共演者の証言からも証明されています。