日常の利用において、インターネット上で議論が絶えないのが「普通列車の乗客がグリーン車のトイレを使ってもよいのか」という規則上の問題です。
JRの旅客営業規則上、グリーン車（特別車両）の客室内へ立ち入るにはグリーン券が必要と定められています。しかし、トイレや洗面台が設置されているデッキ部分は通路としての機能も併せ持っており、鉄道関係者や車掌の現場運用実態に照らし合わせても、「体調不良や緊急時に最寄りのグリーン車トイレを使用すること」自体が不正乗車として咎められることは原則としてありません。
ただし、ここには明確な利用マナーと境界線が存在します。
グリーン車のトイレを利用した後は、決してグリーン車の客席や通路デッキに滞留せず、速やかに普通車デッキへ戻ることが必須要件です。車内改札を行うグリーンアテンダントから見れば、グリーン券を持たずにデッキに留まる行為は「無札での立ち入り」とみなされるリスクがあります。緊急避難的な利用は認められつつも、普通車のトイレが空いているなら普通車側を使うのがトラブルを避ける鉄則です。
もう一つの盲点は、「我慢できないから途中下車して駅のトイレへ行く」という判断です。東海道線の快速や特別快速の場合、一度降りると次の列車まで10〜15分待たされるだけでなく、主要駅（横浜、戸塚、大船など）の駅構内トイレは朝夕に長蛇の列ができています。走行中の車内トイレを利用する方が、結果的にタイムロスも身体的負担も圧倒的に少なくて済むケースが多いのです。
