映画館での劇場上映と劇場限定Blu-ray、配信を組み合わせた多角展開でスタートした本作だが、第1章の段階から作画の不安定さが指摘されていた。バトルシーンにおける躍動感の欠如、キャラクターの遠景描写におけるデッサン崩れ、そして静止画を多用した動きの乏しい演出。SFファンタジーアニメとして本来最大のハイライトであるはずのデジモンたちの進化シーンや戦闘アクションが、前時代のテレビシリーズ以下のクオリティと評される局面に何度も直面した。
かつての興奮を期待して劇場に足を運んだファンにとって、これらの作画の荒れは大きな失望となった。とりわけスクリーンという大画面で強調された作画の乱れは、「往年の名作に対する敬意が足りない」という批判へと直結したのである。