烏丸通に面した京都本店に足を運ぶ最大の価値は、直営旗艦店ならではの充実したラインナップと「本店限定品」の存在にあります。
店頭では、約30種類の香りを少量ずつ試せる「薫々（くんくん）」シリーズの本店限定パッケージや、京都の四季をモチーフにしたオリジナルデザインの香炉・香立が並びます。特に旅行者から高い支持を得ているのが、京都本店オリジナルの匂い袋（サシェ）です。西陣織や京友禅の古裂（こぎれ）を用いた巾着袋に、職人が調合した天然香料を詰めた逸品で、クローゼットや鞄に忍ばせるお土産として長年愛されています。
また、松栄堂が定期開催している「匂い袋作りワークショップ」は、香道文化を身近に体験できる貴重なプログラムです。白檀、丁字（クローブ）、桂皮（シナモン）、龍脳（ボルネオール）といった基本の生薬香料を、専任スタッフの指導のもと自分の好みの調合比率でブレンドしていきます。参加者の手記や体験レポートでも「生薬単体の香りを確かめながら自分だけの香りを作る工程は、日常のデジタル疲れを忘れさせる贅沢な時間」と高い満足度が記録されています。
