長楽館の真の価値は、日中のカフェ営業が終了した後に現れます。館の奥に佇む新館には、全6室のみのラグジュアリーホテル長楽館ホテル宿泊施設が備えられています。
客室はすべて異なる趣を持ち、全室に本物の薪やバイオエタノールの暖炉が設えられています。宿泊者だけの特権として、一般客が退出した後の夜の洋館ラウンジでグラスを傾け、静まり返った円山公園の朝靄を眺めながら洋館の朝食を味わうことができます。利用者のレビューでは「京都のラグジュアリーホテルを泊まり歩いたが、この6室にしかない静寂と本物の重みは他で代替できない」と極めて高い満足度を記録しています。
また、長楽館結婚式口コミにおいても、1日1組限定のプライベートウェディングが絶大な支持を集めています。「作り物の結婚式場にはない、100年の歴史が刻まれた空間が両親や親族に深く喜ばれた」「本物の迎賓館で執り行うセレモニーは、時を経ても色褪せない記憶になる」と、単なる派手さではなく、家と家を結ぶ格式ある門出として高く評価されています。