京王井の頭線 渋谷駅 直結という構造上、井の頭線利用者にとってマークシティは駅そのものです。中央改札を出ればそこはすでにマークシティEASTモールの2階であり、岡本太郎の巨大壁画『明日の神話』が掲げられた開放的な吹き抜け空間が広がっています。
JR線を利用する場合の定番は、JR渋谷駅 マークシティ 連絡通路を活用するルートです。JR山手線・埼京線の中央改札（3階）を出た後、左手（西口・井の頭線方面）へ進み、緩やかな階段・エスカレーターで2階へ下ります。かつての玉川改札があった開口部から西口デッキを通り、そのまま屋内連絡通路へ進入すると、マークシティ2階エントランスへ直結します。
ハチ公改札（1階）から出る場合は、外のスクランブル交差点側に出ず、構内左手にある「しぶちか」階段脇のエスカレーターを利用して2階へ上がるのがポイントです。地上の人混みを完全に回避し、スムーズに館内へ入ることができます。
