スマートフォン向け位置情報ゲーム『Pokémon GO』においても、ゲンガー系統の色違いは屈指の人気を誇ります。しかし、狙うシチュエーションによって遭遇確率は大きく異なります。
ポケモンGO ゲンガー 色違い 確率は、通常の野生出現時でおよそ約1/500（約0.2%）と非常に狭き門です。野生のゲンガー自体がレア出現であるため、フィールド探索だけで色違いを引き当てるのは現実的ではありません。
最も効率的な入手ルートは定期的に開催される「メガレイド」です。メガレイドのボスとして登場するゲンガーを倒した後の捕獲画面では、色違いの出現確率が約1/64（約1.56%）まで大幅に優遇されています。さらに、『Pokémon GO』のレイドバトルで出現する色違いポケモンは「プレミアボールを1発当てるだけで確定捕獲（捕獲率100%）」という仕様があるため、金ズリを使わずにパイルのみ等を使ってアメを最大化しながら安全に確保できます。
