インターネット上の掲示板やSNS、Googleマップ等に寄せられる評判・口コミを精査すると、市立函館病院に対する評価は明確に「医療技術の信頼性」と「待ち時間の長さ」という二極に分かれています。
好意的なレビューでは、「他院で原因不明だった症状を精密検査で即座に見つけ出してもらえた」「手術前の説明が丁寧で、家族も含めて不安を取り除いてくれた」「救命センターの迅速な処置で一命を取り留めた」といった、高度急性期病院ならではの設備力とスタッフの対応力に対する厚い信頼が目立ちます。
一方、低評価の主たる要因となっているのが、診察および会計待ちの長時間化です。「予約時間から1時間以上待たされた」「採血と画像検査だけで午前中が潰れた」といった不満の声は少なくありません。ただし、これは重症患者の急変対応や詳細な術前説明を最優先する基幹病院の構造的特性であり、単なる事務処理の遅延とは性質が異なります。待ち時間を最小限に抑えるためには、自動再来受付機の活用や、混雑ピーク（午前9時半〜11時）を外した会計手続きが実用的な自衛策となります。
