宮崎地方裁判所で開かれた公判では、不同意性交等致傷罪という重罪に対する量刑が最大の争点となりました。刑法改正によって新設・厳格化された不同意性交等罪において、被害者に傷害を負わせた場合の法定刑は「無期または5年以上の懲役」と極めて重く設定されています。
検察側は「市議会議員という公職の立場にありながら、自己の性欲を満たすために被害者の尊厳を著しく踏みにじった悪質な犯行であり、反省の態度も不十分である」として厳罰を求めました。これに対し弁護側は、事実関係を一部認めつつも計画性のなさや示談に向けた動きなどを挙げ、情状酌量を訴えました。
裁判所は、被害女性が受けた精神的・肉体的苦痛が極めて深刻であること、公職者としての倫理観を著しく欠如させていたことを厳しく断罪しました。結果として、宮崎地裁は西本誠に対し懲役4年6ヶ月の実刑判決を言い渡しました。執行猶予のつかない実刑判決が確定したことで、政治家としてのキャリアは名実ともに完全に断たれることとなりました。