高学年を持つ保護者にとって最大の関心事の一つが、卒業後の進路です。香椎東小学校の主な中学校の進学先は、公立進学の場合は隣接する「福岡市立香椎第二中学校」となります。
香椎第二中学校は学力レベルや部活動の実績も安定しており、県立の進学校（福岡高校や香住丘高校、新宮高校など）を目指す土台として定評があります。小学校時代から顔なじみの仲間とともに進学できる安心感から、大半の児童が公立ルートへ進みます。
同時に、文教志向の家庭が一定数存在することから、私立中学校や国公立中高一貫校への中学受験比率も決して低くありません。福岡教育大学附属福岡中学校をはじめ、西南学院、福岡大学附属大濠、早稲田佐賀といった難関・人気校を目指して、近隣の学習塾へ通う児童も日常的な光景となっています。公立・私立のどちらを選択しても、周囲から浮くことなく前向きに切磋琢磨できる進路環境が整っています。
