第七機動隊を語る上で欠かせないのが、特定の危機状況に特化したスペシャリスト部隊の存在です。なかでも警視庁第七機動隊の水難救助隊は、全国の警察関係者からも一目置かれる存在として知られています。
多摩川をはじめとする河川での水難事故、ゲリラ豪雨による都市型水害、さらには海底や暗渠での証拠品捜索まで、視界ゼロの濁流に潜水して命懸けの活動を展開します。過酷な潜水技術と強靭なメンタルを要求されるため、選抜された隊員たちは季節を問わず極寒の水中訓練に身を投じています。
さらに、銃器や爆発物を用いた凶悪テロを想定した「銃器対策部隊」や、山岳遭難・高所救助を担う「レンジャー小隊」も編制されています。サブマシンガンや防弾シールドを装備し、電光石火の突入訓練を繰り返す銃器対策部隊の練度は、特殊急襲部隊（SAT）に次ぐ即応打撃力として首都の要衝を常時ガードしています。
