中島健人の家族構成は、父親・母親・本人の3人家族です。兄弟はおらず一人っ子として愛情を一身に受けて育ちました。
ファンの間では「ハーフなのかクォーターなのか」という疑問が長年語られてきましたが、正確には母親がフィリピン人と日本人のハーフであり、父親が日本人であるため、中島健人本人はフィリピンの血を4分の1引くクォーターです。彫りの深い端正な顔立ちや豊かな表現力、抜群のスタイルには、このルーツが自然に反映されています。
生まれは東京都ですが、少年期は千葉県浦安市などの落ち着いた住環境で過ごしたことが知られています。幼少期からクラシックピアノを習い、私立の中高一貫校から大学へと進学した経歴から、ネット上では「実家はかなりの大金持ちではないか」と推測されることも少なくありません。実際には、莫大な資産家というよりも、教育と教養に惜しみなく投資を行うアッパーミドル層(上位中流家庭)の堅実で豊かな環境で育ったといえます。