激しい痛みを伴う足裏の魚の目を根本から解消するためには、皮膚科専門医による適切な医療処置を選択するのが最も安全かつ確実な近道です。病院で行われる足の裏の魚の目の皮膚科治療は、病態や進行度に応じて段階的に組み立てられます。
最も一般的な基本処置は、メスやコーンカッター、医療用剪刀（ハサミ）を用いた「削開（さっかい）および除核」です。熟練した皮膚科医は、真皮組織を傷つけることなく、角質化した芯の境界線を正確に見極めながら、円錐形の芯を無痛で摘出します。角質細胞自体には神経が通っていないため、正常組織を侵さない限り麻酔なしでも痛みを感じることはほぼありません。頑固な芯が奥深くまで達している場合は、サリチル酸製剤を数日間塗布して組織を十分に軟化させた上で処置を行います。
一方、診断の結果がウイルス性イボであった場合、魚の目のように削る処置は原則行われません。標準治療として選択されるのは、マイナス196度の液体窒素を用いた液体窒素凍結療法（クライオセラピー）です。綿棒や専用スプレーで病変部を急激に凍結・融解させ、ウイルスに感染した細胞を組織ごと壊死させて剥落を促します。難治性の病変や再発を繰り返す症例に対しては、自費診療を含む選択肢として、病変組織を熱エネルギーで正確に蒸散させる炭酸ガス（CO2）レーザー治療やパルス色素レーザー（Vbeam）治療が導入されるケースもあります。
医療機関での治療費用は、保険適用の魚の目削開処置であれば3割負担で初診料を含めて千数百円から2千円程度、液体窒素療法も1回あたり千円前後が一般的な相場です。自己流で刃物を突き立てて化膿させ、抗生剤の点滴や切開排膿が必要になるリスクを考慮すれば、早期の医療機関受診が医学的にも経済的にも圧倒的に合理的です。
