『妖怪ウォッチバスターズ』のゲーム体験を画期的なものにした最大の要素が、Bメダルとの物理的な連動機能である。メダルの裏面に印刷されたQRコードには個別の識別データが組み込まれており、ニンテンドー3DSのカメラ機能を使って読み取ることで、ゲーム内で即座に特典アイテムがプレゼントされる仕組みだ。
このシステムは単なる玩具のオマケにとどまらず、ゲーム本編と現実の玩具展開を完璧に融合させた。イベント会場での限定配布メダルや、特定の関連グッズにしか同梱されなかったレアメダルのコードには、ゲーム内の未公開データや特殊な装備レシピを解禁するフラグが含まれており、当時の子どもたちやコレクターを夢中にさせた。