ジャーナリズムにおいて最も神聖な原則とされるのが、情報源の秘匿 取材源保護です。過去の最高裁判例（博多駅テレビフィルム提出命令事件や島田倶楽部事件等）においても、報道機関の取材源の秘匿は憲法第21条が保障する表現の自由・報道の自由の根幹をなすものとして尊重されています。
NHKの報道現場においても、情報提供者の身元や連絡先は暗号化された厳重なシステム内で管理され、取材を担当するごく一部の記者・デスク以外には伏せられる運用が徹底されています。捜査機関や裁判所から取材資料の提出を求められた場合でも、NHK側が取材源の特定につながる情報を開示することはありません。
企業や官公庁の不正を暴くNHK 内部告発 公益通報窓口を利用する場合、通報者は「公益通報者保護法」の保護対象となり得ます。しかし、法的な保護を受けるためには「不正の事実を示す相当の根拠（真実相当性）」が必要となります。単なる憶測や伝聞だけで社名を出して告発した場合、名誉毀損や業務妨害に問われるリスク、あるいは勤務先からの懲戒処分リスクを完全に排除することは困難です。
内部告発を行う際は、メールの送受信履歴、社内稟議書、会議音声、改ざん前のデータなど、第三者が客観的に違法性を確認できる物的証拠を揃えることが自らの身を守る最大の防壁となります。
