「胃カメラ経鼻経口どっちが楽なのか」という問いに対する医学的な基本解は、経鼻内視鏡のほうが嘔吐反射を起こしにくいという点にあります。胃カメラの最大の苦痛として挙げられる「オエッ」という激しいえずきは、医学的には「咽頭反射（いんとうはんしゃ）」と呼ばれます。これは、喉の奥にある舌の付け根（舌根部）や咽頭後壁に異物が接触した際、気道を守るために身体が無意識に異物を吐き出そうとする正常な生体防御反応です。
口からスコープを挿入する経口内視鏡では、構造上どうしても舌根部をスコープが直接圧迫しながら通過するため、強い反射が誘発されます。これに対し、経鼻内視鏡苦しくない理由は、スコープが鼻腔を通り、咽頭天井部をかすめて食道へと滑り込む解剖学的ルートをとるためです。カメラが舌の根元に直接触れないため、咽頭反射がほとんど誘発されず、検査特有の息苦しさや吐き気を大幅に低減できます。
日本消化器内視鏡学会に所属する専門医らの臨床報告でも、「経鼻内視鏡を受けた患者の約9割が、従来の口からの検査と比べて楽だったと回答した」というデータが示されています。さらに、口が完全に塞がれないため、検査中に医師と「少し痛みます」「今、十二指腸を見ていますね」といった会話ができることも、受診者の精神的な安心感に大きく寄与しています。
