ウェブ検索や知恵袋などでしばしば目にする「高額な民間療法や断食でクローン病が自然治癒した」「奇跡の水で治った」という噂には、極めて危険な認知の罠が潜んでいます。日本消化器病学会や関連学会の報告においても、クローン病が医学的介入なしに真の自然治癒を遂げたという科学的エビデンスは過去に一切存在しません。
この「自然治癒した」という錯覚が生まれる背景には、クローン病特有の「再燃と寛解を繰り返す自然経過の波」が関係しています。治療を行わなくても、一時的に免疫の過剰応答が沈静化し、数ヶ月から1年程度にわたって症状が軽快する「見かけ上の偽寛解」が訪れることがあります。悪質な代替療法や情報商材は、この偶然の波を「民間療法の効果」と誤認させ、高額な契約を結ばせる温床となってきました。
また、闘病ブログ等で「生物学的製剤の効果が出たため、注射をやめた」という経緯を目にして、「薬をやめて完治したんだ」と早合点する読者も少なくありません。しかし、専門医による計画的な投薬中断（いわゆるBio-free戦略）と、個人の自己判断による投薬拒否は完全に別次元の話です。
近年、内視鏡的粘膜治癒が2年以上完全に確認され、バイオマーカーも陰性を維持している限定的な症例において、患者の希望や副作用リスク、医療費負担の観点から生物学的製剤を慎重に休止する臨床試験（寛解維持期のステップダウン）が行われるケースはあります。しかし、多施設共同研究の追跡データによれば、生物学的製剤を中止した患者の約40〜50%が2年以内に再燃を来すことが示されています。
さらに見過ごせないのが、行政制度との関わりです。クローン病は厚生労働省の「指定難病（告示番号96）」に指定されており、重症度分類（CDAIスコアや重篤な合併症の有無）に基づき特定医療費（指定難病）受給者証が交付されます。寛解期が長く続いて症状が軽快すると、更新審査において助成基準から外れる（「軽症かつ高額な医療を継続していない」と判断される）場合があります。これを行政手続き上「難病指定から外れた＝完治した」と混同してSNS等に書き込む事例が散見されますが、これは医学的な完治を意味するものでは決してありません。
