サンマリーンながの最大の魅力は、天候に左右されない広大な屋内アクアゾーンです。海なし県の長野にいながら本格的な波を体感できる「造波プール（波の出るプール）」をはじめ、ゆったりと水流に乗ってリフレッシュできる「流水プール」、泳力を鍛える本格的な「25m公認プール」、小さな子どもが安全に水遊びを楽しめる「幼児用プール（じゃぶじゃぶ池）」が整備されています。
なかでも人気を集めるのが、高低差とスピード感が抜群の2大ウォータースライダーです。利用にあたっては安全管理上の観点から明確な制限が敷かれています。
- スライダー利用制限：身長120cm未満の方は利用不可（年齢に関わらず厳格な測定が行われます）。また、アクセサリー類や眼鏡（度付きゴーグル除く）、時計を着用したままの滑走は禁止されています。
- スライダーの種類：専用マットや浮き輪を使って滑走するチューブタイプと、体一つでスリルを味わうボディスライダーが設置されており、順番待ちの列が分かれています。
- 浮き輪の持ち込みルール：一般的なドーナツ型浮き輪（直径100cm前後まで）はプールエリアへの持ち込みが認められています。プールサイドには無料の電動コンプレッサー（自動空気入れ）が設置されているため、現地で手軽に膨らませることが可能です。ただし、大型のイルカ型フロート、ベッド型マット、オール付きのボート類は他利用者との接触事故防止のため混雑時は持ち込みが制限・禁止されます。
