物流業界における運行管理の適正化や燃料価格・電気料金の変動を背景に、2026年現在、各配送会社の運賃体系はより明確なコスト連動型へとシフトしています。クール便の配送料金は、距離とサイズに応じた「基本運賃」に、温度管理を維持するための「クール付加料金」が上乗せされる構造です。
ヤマト運輸の宅急便を例にとると、クール付加料金はサイズごとに以下のような設定となっています（2026年の標準的な加算体系）。
- 60サイズ（2kgまで）：基本運賃 ＋ 275円（税込）
- 80サイズ（5kgまで）：基本運賃 ＋ 330円（税込）
- 100サイズ（10kgまで）：基本運賃 ＋ 440円（税込）
- 120サイズ（15kgまで）：基本運賃 ＋ 715円（税込）
注意しなければならないのがサイズ・重量の厳格な上限です。普通便であればヤマト運輸は200サイズ（30kg）まで対応していますが、クール宅急便の上限は120サイズ・15kgまでに制限されています。佐川急便は140サイズ・30kgまで対応していますが、それを超える大型貨物はクール便として引き受けできません。箱の3辺合計が小さくても、水分を多く含んだ魚介類などで重量が15kgを1gでも超えてしまうと規格外扱いとなるため、計量は必須です。
さらに、万が一の事故が発生した際の補償限度額は、ヤマト運輸の場合お荷物1個につき30万円（税込）までと定められています。高級なワインや希少な牛肉などを送る際は、この責任限度額を念頭に置いたリスク管理が必要です。
