インテリアの基本レイアウトは共通の「オモテナシ」空間が広がりますが、細部のカラーコーディネートや素材使いに明確な違いが宿ります。アルファードの内装には落ち着きのある「ブラック」や高級感漂う「ニュートラルベージュ」が用意され、上質なリビングのような穏やかな空間を創出しています。ヴェルファイアには専用の「サンセットブラウン」が設定され、華やかさとスポーティな緊張感を高めています。
最上級グレードである「Executive Lounge(エグゼクティブラウンジ)」同士を比較した場合、基本装備となるオットマン付きパワーシートや回転格納式テーブル、脱着式スマートフォン型集中コントロールパネルなどは共通です。しかし、走行中の静粛性に対するアプローチや内装ステッチの配色など、細やかな意匠によってヴェルファイアは躍動感を、アルファードは静謐なラグジュアリーを演出しています。