私生活において、牧瀬里穂さんは2008年12月にファッションプロデューサーで世界的デザイナーのNIGO(ニゴー)氏と結婚を発表しました。人気絶頂の女優と、ストリートファッション界を牽引する世界的クリエイターの電撃婚は大きな話題を呼びました。
結婚から年月を経た現在も、夫婦仲は極めて円満であることで知られています。世界的ファッションブランド「KENZO」のアーティスティックディレクターや「Human Made」を手掛け、世界中を飛び回る多忙な夫を、牧瀬さんは家庭から温かくサポートし続けています。
お互いの感性を尊重し合うライフスタイルは多くの女性の憧れとなっており、洗練された都心の住まいやアートに囲まれた丁寧な暮らしぶりは、雑誌のインタビューや特集でも度々紹介されています。