14年間の歴史を振り返る上で欠かせないのが、スタジオを温かく見守り続けた歴代出演者の存在です。番組の顔となったMC陣の変遷は、番組のテイストの変化をそのまま象徴していました。
- 第1期（2009〜2015年）：品川祐（品川庄司）、大島美幸（森三中）、岡田圭右（ますだおかだ）。芸人ならではの切れ味鋭いツッコミと、渡辺徹さんの温かみあふれるナレーションが科学の敷居を一気に下げました。
- 第2期（2015〜2018年）：ユージ、春香クリスティーン、白本彩奈。よりティーン・ファミリー層に寄り添った明るいスタジオトークを展開。
- 第3〜4期（2018〜2023年）：いとうあさこ、横山だいすけ。「あさこさん」「だいすけお兄さん」の安定した包容力により、ガールズたちの自由な発想を丸ごと受け止めるアットホームな教育バラエティへと昇華。
そして、視聴者に最も強烈なインパクトを残したのが、ご意見番として君臨した俳優・伊吹吾郎の存在です。『水戸黄門』の格さん役で知られる大御所俳優が、ガールズたちの突拍子もない実験を誰よりも真剣な眼差しで見つめ、「うーむ！なるほど！」と子供のように膝を打つリアクションは、世代間ギャップを埋める最高のスパイスでした。権威を振りかざさず、共に不思議がる伊吹吾郎のスタンスこそが、番組の「誰も排除しない科学の楽しさ」を体現していたのです。
