高等部までの接合教育も同校の大きな強みだ。「武蔵野東中学校・高等学校」へと進学する中で、生徒たちは個別の特性に応じた専門的なキャリア教育を受ける。健常児クラスの生徒たちは高い学力を維持し難関大学へ進学する一方、自閉症クラスの生徒たちも技能習得や就労支援手厚い指導を受け、高い就職・進学実績を誇っている。
卒業生たちの社会的自立に向けたサポートは手厚く、自立した生活を送る姿は多くの後輩たちの希望となっている。中高の段階でも混合教育の精神は脈々と受け継がれており、社会に出てから必要となる真のコミュ二ケーション能力が養われる。
