ネット上の一部では「至学館は部活がメインで、進学先は系列の至学館大学ばかりではないか」という誤解が根強く残っています。しかし、最新の至学館高校の進路実績を子細に検証すると、実態は大きく異なっていることが判明します。
もちろん、健康科学やスポーツ科学、栄養科学の分野で高評価を受ける至学館大学への内部推薦枠は強固なセーフティネットとして機能しています。しかし、外部受験を選択する生徒の内訳を見ると、愛知県内の名門私立である南山大学、名城大学、中京大学、愛知大学といった「南愛名中」への合格者を毎年手堅く輩出しています。
アドバンスコースからは愛知県立大学や名古屋市立大学などの国公立大学現役合格者もコンスタントに誕生しており、「指定校推薦の枠組みを戦略的に利用して中堅〜難関私大を目指すルート」と「一般入試で学力勝負を挑むルート」が機能的に分担されています。文武両道を掲げ、部活動での実績を総合型選抜（旧AO入試）のアピール材料に昇華させて有名大学を突破する生徒が多い点も、同校の隠れた強みです。
