椙山女学園高校の最大の強みの一つが、進路選択の柔軟性にあります。卒業生の進路は大きく「系列大学への内部進学」と「外部の他大学への進学」に分かれます。
椙山女学園大学への内部進学率は約35〜45％となっており、管理栄養学科や教育学部、看護学部など、資格取得や国家試験に強い学部への進学が特に人気を集めています。一定の成績基準を満たせば優先的に進学できる権利を確保できるため、受験ストレスに過度に縛られず、高校3年間で部活動や課外活動に打ち込めるメリットがあります。
一方で、残る半数以上（約55〜65％）の生徒は他大学へ進学しています。歴史ある伝統校ならではの強みとして、豊富な指定校推薦枠が挙げられます。早稲田大学、慶應義塾大学、上智大学、東京理科大学をはじめ、MARCH（明治・青山学院・立教・中央・法政）や関関同立（関西・関西学院・同志社・立命館）、さらには南山大学などの地元主要大学への推薦枠を多数保持しています。また、国公立大学や難関私大の一般選抜に挑戦する生徒向けの補習や進路指導体制も整えられています。
