私立高校を選択する際、学費や奨学金制度の充実は重要な判断基準となります。三田松聖高校の初年度納付金は、入学金や授業料、施設費を含めて約80万〜90万円前後が標準的な目安です。国の「高等学校等就学支援金」や兵庫県の「授業料軽減補助金」の対象となるため、世帯年収に応じた実質負担額は大幅に軽減されます。
また、同校では学業成績優秀者やスポーツ・文化活動で優れた実績を持つ生徒を対象とした特待生制度（スカラシップ）を用意しています。学業特待では入試得点や中学校の内申点に応じて入学金や授業料の全額・半額免除が適用されるケースがあり、意欲的な生徒を経済面から力強くバックアップしています。
入試日程は例年2月上旬に実施され、推薦入試（専願）と一般入試（専願・併願）が行われます。推薦・専願入試の実質倍率は1.0〜1.2倍程度で推移しており、出願基準を満たしていれば手堅い合格が見込めますが、特進コースを併願で受験する場合は、公立校入試を見据えた確実な得点力が求められます。
