東進の自習室に関して最も多い誤解の一つが、「有料自習室のように自習スペースだけを安価に月額契約できるのではないか」という期待です。前述の通り、自習室のみの単独利用プランは存在しません。原則として通年講座(1講座あたり約7万7,000円〜)の受講と、担任指導費・模試費などの諸経費を納入している正規在籍生のみに利用権が付与されます。
また、「日曜日も夜遅くまで使えると思っていた」という通塾後のギャップも頻発しています。東進の校舎スケジュールにおいて、日曜・祝日は19時前後で閉館する校舎が大多数を占めます。これはスタッフの労務管理や校舎メンテナンスの観点から設定されているケースが多く、日曜日も22時近くまで勉強したい受験生は、自宅学習や公共図書館など代替の学習拠点を併用する計画を立てておく必要があります。