メガシンカを選択した際、ポケモンの特性はコマンドを入力したターンの「そのポケモンの行動時」ではなく、ターン開始時のメガシンカ演出が入った瞬間に書き換わります。この仕様はバトルの組み立てにおいて極めて大きな意味を持ちます。
例えば、登場時に発動する特性(「いかく」や「すなおこし」など)を持つポケモンの場合、通常状態で場に出て相手の能力を下げた後、次ターンにメガシンカして攻撃的な特性へシフトするという2段構えの運用が可能です。一方で、メガシンカ前の特性が消えるタイミングを読み誤ると、受けるはずだった恩恵を逃すリスクも孕んでいます。
また、メガストーンの持ち物仕様として「はたきおとす」で叩き落とされず、「すりかえ」「トリック」でも奪われない固定枠となるため、相手のアイテム妨害を受けない安定性もメガシンカの隠れた強みです。