映画を観ている多くの人が混同しやすいポイントが、前日譚（プリクエル）に登場するクローントルーパーとの違いです。結論から言えば、この2つは出自も組織体制も全く異なる存在です。
クローントルーパーは、伝説の賞金稼ぎジャンゴ・フェットの遺伝子を元にカミーノのクローン施設で生み出された生粋の戦闘エリートでした。高度な戦術教育を受け、驚異的な射撃精度と忠誠心を誇っていましたが、成長速度が通常の2倍に設定されていたため加齢が早く、部隊の維持費も莫大でした。
銀河帝国の樹立後、皇帝パルパティーンと帝国上層部は「プロジェクト・ウォー・マントル」を発動してクローン製造ラインを廃止。銀河各地の惑星から集めた一般市民の志願兵および強制徴兵された若者たちへと兵力を完全に移行しました。これがストームトルーパーの正体です。思想統制と厳格な訓練を受けさせられたものの、個々の戦闘能力や忠誠心にはばらつきがあり、結果として部隊全体の戦闘クオリティはクローン軍時代よりも低下することになりました。
