啄木亭の最大のストロングポイントは、最上階（11階）に位置する空中大浴場と露天風呂です。湯船に浸かりながら函館市街の夜景や雄大な函館山、遠く津軽海峡まで見晴らすパノラマビューは圧巻の一言に尽きます。湯の川の風情を感じながら自家源泉の湯を贅沢に味わえる設計は、他館の追随を許さない開放感を誇ります。
プライベートな入浴を重視する旅行者には、湯元啄木亭の貸切風呂（家族風呂）が好評を博しています。周囲に気兼ねなく名湯を満喫できるため、小さな子ども連れのファミリー層やカップルから高い支持を集めています。
宿泊客だけでなく、地元客や日帰り旅行者にも門戸が開かれています。啄木亭の日帰り入浴料金は大人1,000円前後（※フェイスタオル付・バスタオル有料貸出あり）と手頃な設定になっており、観光の合間や函館アリーナでのイベント前後に気軽に立ち寄れる温泉スポットとしても定着しています。
