東京屈指の人気を誇る名店だからこそ、訪問時のハードルとなるのが「行列と待ち時間」です。井の頭線「駒場東大前駅」東口を出て徒歩1〜2分という好立地にあり、東京大学駒場キャンパスの学生や教職員、近隣のビジネスパーソン、さらには全国から訪れる定食ファンで常に賑わっています。
駒場東大前 菱田屋 ランチの混雑ピークは11時45分から13時00分。この時間帯に到着した場合、平日でも30分〜45分、土曜日や天候の良い日には60分超の待ち時間が発生することが珍しくありません。店内はテーブル席とカウンター席が効率よく配置されているものの、注文が入ってから一品ずつ丁寧に強火調理するため、過度な高速回転は行われません。
行列を最小限に抑える最大の戦略は、「開店時間の20〜30分前（11時00分〜11時10分頃）に現地へ到着し、1巡目の入店枠を確保すること」です。1巡目で着席できれば、11時30分の開店からスムーズに料理が提供され、タイムロスを最小限に抑えることができます。
なお、昼の定食営業における菱田屋 予約方法は存在せず、完全な来店順（並び順）です。代表者のみの順番待ちはマナー違反となるため、必ず全員が揃ってから列に並ぶ必要があります。
夜の部に関しては、近年隣接して展開された「菱田屋酒場」の存在を把握しておく必要があります。定食を黙々と味わう昼の雰囲気とは異なり、夜は名物の一品料理や刺身、そして生姜焼きをつまみに酒を酌み交わす大衆酒場スタイルへとシフトします。夜の酒場利用であれば事前連絡や予約が可能な場合もあるため、ゆったりと菱田屋の味を楽しみたい大人は夜の訪問も有力な選択肢です。
